При наявності скарг чи підозри на якесь захворювання проводиться один раз на рік. Профілактична. Показана хворим, які страждають на патології шлунково-кишкового тракту. Виконується один раз на 6-12 місяців.

Обстеження не завдає жодної шкоди здоров'ю, тому проводити її можна, можливо стільки, скільки скаже лікар. При гастриті або інших патологіях можлива необхідність у гастроскопії збільшиться до 3 разів на рік (раз у 4-6 місяців) для відстеження динаміки захворювання.

При високого ступеня атрофії слизової оболонки шлунка важливо спостерігатися за допомогою ФГДС 1 раз на рік, щоб була можливість виявити рак на ранній стадії.